Resmi Gazete'de yayımlanan Bakanlar Kurulu Kararı'na göre sistem şu şekilde işleyecek: Elektrik şirketi abone/tüketici kayıtlarıyla Çiftçi Kayıt Sistemi'ni eşleştirecek. Alacaklı olduğu çiftçilere ait kimlik veya vergi numarasını bankaya iletecek. Banka numaraları eşleştirerek borcu olması halinde tarımsal destekleme bedelini çiftçiye ödemeyecek. Ödemenin yapılabilmesi için şirketten çiftçinin veya tüzel kişinin bankaya müracaat tarihinden önceki bir ay içinde alınan belgenin finans kurumuna ibraz edilmesi gerekecek.