4688 sayılı Kamu Görevlileri Sendikaları ve Toplu Sözleşme Kanunu hükümleri uyarınca 2012 ve 2013 yılları için kamu görevlilerinin geneline ve hizmet kollarına yönelik mali sosyal hakları belirlemek üzere 30.04.2012-21.05.2012 tarihleri arasında gerçekleştirilen TOPLU SÖZLEŞME’nin "Ulaştırma Hizmet Koluna" İlişkin Mali ve Sosyal Haklarla İlgili Toplantı tutanağının KİT’lerde Konut kira bedeli başlıklı 7. maddesinde "1.7.2012 tarihinden geçerli olmak üzere, kamu iktisadi teşebbüslerince bedeli karşılığı kamu konutu tahsis edilen personelden, her yıl Milli Emlak Genel Tebliğlince yayınlanan kira birim bedellerinin % 85’i tahsis edilir" hükmü yer almaktadır.

Ancak, Maliye Bakanlığının 01.06.2012 tarih 15913 sayılı genelgesinin 12.maddesinde kira bedellerinin % 85’i ile alınacağı ve bedel üzerinden 3065 sayılı kanuna göre hesaplanan KDV tutarının toplamının ilgiliden tahsil edileceği belirtilmiştir.
 
Bu nedenle TCDD ve Bağlı Ortaklıklarının lojmanlarında oturanlardan, 1.7.2012 tarihinden geçerli olmak üzere kira bedelinin % 85’ i tahsil edilmiş olmasına rağmen üzerine KDV ilave edilmiştir, Ayrıca yakıt bedelinden ise % 85 e indirmeden KDV uygulayarak kesinti yapılmıştır.
 
Konuyla ilgili Türk Ulaşım sen tarafından, TCDD Genel Müdürlüğü’ne 20.12.2012 tarih 165 sayılı ile Lojmanlarda kullanımı ve yakıtı kurum tarafından karşılanan yakıt bedellerinin de % 85’i oranında ücret alınması gerektiği konusunda yazı yazılmış, ayrıca, Kira ve Yakıt bedellerinin üzerinden ayrıca KDV alınamayacağı hususu ile ilgili Maliye Bakanlığı Bütçe ve Kontrol Genel Müdürlüğüne 20.12.2012 tarih 166 sayılı yazı yazılmıştır.

Ancak TCDD Genel Müdürlüğü’ne ve Maliye Bakanlığı’na gönderilen yazılara ilişkin olumsuz cevap gelmesi üzerine, Türk Ulaşım Sen tarafından, yargı yoluna başvurulmuş ve Ankara 4. İdare Mahkemesi 2013/546 sayı ile, Danıştay 4. Dairesi Başkanlığı 2013/376 sayı ile dava açılmıştır.