Özel yetkili cumhuriyet savcıları Ercan Şafak ve Murat Yönder tarafından yürütülen soruşturmanın ardından hazırlanan iddianameyi İstanbul Cumhuriyet Başsavcı Vekili Turan Çolakkadı onaylayarak İstanbul 12. Ağır Ceza Mahkemesi'ne gönderdi. Bu şekilde Ergenekon soruşturması kapsamında İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı'nca altıncı iddianame hazırlanmış oldu. Başsavcı Vekili Çolakkadı, "Kafes Eylem Planı" iddialarına ilişkin soruşturmanın tamamlanmasının ardından hazırlanan iddianamenin 12. Ağır Ceza Mahkemesi'ne, Poyrazköy'de ele geçirilen mühimmatla ilgili soruşturma sonucu açılan davayla birleştirilmesi talebiyle gönderildiğini söyledi. "Poyrazköy cephaneliği ve "amirallere suikast" davalarına bakan İstanbul 12. Ağır Ceza Mahkemesi'nin yasal olarak 15 gün iddianameyi inceleme süresi var. Savcılar. "hukuki ve fiili irtibat" gerekçesiyle Poyrazköy cephaneliği davası ile Kafes Eylem Planı davasının birleştirilmesini talep etti.
Türkiye'deki azınlıklara suikastlar düzenlenerek kaos ortamı oluşturmayı hedeflediği öne sürülen Kafes Eylem Planı adlı belge emekli Binbaşı Levent Bektaş'tan ele geçirilmişti. Belgenin 21 Nisan 2009'da Poyrazköy kazılarıyla ilgili tutuklanan Bektaş'a ait 51 No'lu DVD'de yer aldığı ileri sürülüyor. Eylem planında, AK Parti'nin üzerindeki baskıları artırarak hükümeti yıpratmak için gayrimüslimleri hedef alan eylemler bulunuyordu. Dört aşamalı plandaki haritada, hangi ilde kaç gayrimüslim temsilcisinin bulunduğu ayrıntılarıyla yer alıyordu. Planda, operasyonun gayrimüslimlerin fişlenmesinden suikast ve bombalı eylemlere kadar birçok eylemin yapılması öngörülüyordu. Soruşturma kapsamında Kafes Eylem Planı'nda adı geçen, aralarında Güney Deniz Saha Komutanı Kadir Sağdıç, Çıkarma Gemileri Komutanı Tuğamiral M. Fatih Ilgar ve emekli Koramiral Ahmet Feyyaz Öğütçü'nün de bulunduğu 41 kişinin ifadesi alınmıştı. Deniz Kuvvetleri Komutanlığı'nda görevli 7 askeri personel ise soruşturma kapsamında tutuklanmıştı.  Zaman